2011年閻雲擔任校長後，除了延續過去醫學教育為主外，再導入「生醫臨床為用的研究型大學」為新定位，突破過去臺北醫學院的框架，以達到總體改造，希望在醫學上有特色，在研究上能聚焦，在生醫上有導向，同時進行組織再造，這些在近兩年已有相當成效，目前正著手10年藍圖總規劃。
北醫大在英國教育機構QS（Quacquarelli Symonds）2014年世界大學的排名379（連續4年居前400），2015年亞洲大學排名47（連續3年居前50大）。2014年首度以「癌症轉譯研究中心」獲教育部通過邁向頂尖大學計畫補助1億元，計畫主持人由張文昌院士、劉昉院士、彭汪嘉康院士與閻雲擔任。
該中心轉譯的兩大目標為：抗癌藥物研發、癌症分子標誌，希望將研發成果轉譯於臨床運用，再技術移轉給產業界；同時要將臨床上的發現，再回頭深化基礎研究。近幾年本校在教學與研究上的整體概況如下。【左圖：北醫大近年在國際大學排名表現績優外，2014年更獲選教育部通過邁向頂尖大學計畫】
▓深化教學品質
本校自100學年（2010年）迄今經教育部核准通過增設19個系所學位學程（含11個博班），今年8月1日又增設醫學工程學院及管理學院，總計有9學院、13學系、23研究所，其中最重的是醫學工程學院內的「奈米醫學工程研究所（博士班）」，與美國南加州大學（University of Southern California, USC）合辦招收國際學生，且不同於雙聯學位，學生在兩校各研讀兩年，可分別獲得北醫大與南加大兩張文憑。管理學院則以大數據、生技管理為發展重點，醫務管理沒有數據的分析就無執行力，因此大數據作為管理學院的重要訴求。【右圖：閻雲校長（右）與USC工程學院院長Dean Yannis Yortsos簽訂合約】
北醫大連續10年獲得教育部教學卓越計畫補助累計至6.7億元，且每年補助金額逐年攀升，104學年度已為全國補助的第3名；本校應屆畢業生在醫師、牙醫師、護理師、牙體技術師的國考通過率皆高於90%；本校博士班（PhD）的名額不多，但報到率幾乎100%，優於全國其他大學的，主要是北醫大在獎學金、出國進修、參與研究及師生傳承方面的規劃很有願景。【上圖：醫學工程學院（左圖）及管理學院（右圖）於2015年8月1日成立並陸續舉辦揭牌典禮】
學校在教學方法上，近年十分著重於磨課師（MOOCs）課程，目前已上架英文閱讀、中藥概論、醫學資訊學、食安專題、居家照護與技巧等14種課程，除與國內的清華大學「ShareCourse」及交通大學「ewant平臺」合作，2015年2月成為全國大專院校第一個登上蘋果公司「iTunes U平臺」的學校，6月又加入歐洲最大線上課程平臺「FutureLearn」，也是臺灣第一個與該平臺簽約合作的機構。【左圖：王靜瓊教授主授的《中藥概論》是「ewant平臺」上最受歡迎的課程之一，選課人數突破上千人】
▓聚焦研究
三所附屬醫院是北醫大最重要的資產，可以直接延續我們的研究，直接達到轉譯功能，我們有萬芳醫學中心的引領，北醫附醫優質的標準，雙和醫院第二醫療大樓在2014年7月完成第二期建置，床位達到1,500多床。三所醫院全部通過美國臨床研究受試者保護評鑑（AAHRPP），且均以「Full Accreditation」通過認證；北醫大更結合三附屬醫院臨床研究能量取得衛生福利部的「癌症卓越研究計畫」（2010～2017）獲2.6億元補助，及「卓越臨床試驗研究計畫」（2005～2016）獲3.4億元補助；其中，TMU-CECR還獲衛福部選為國內8家卓越癌症研究中心之一。【右圖：北醫附醫2014年接受AAHRPP評鑑情形】
由本校與臺大研究團隊合作研發的「小分子抗癌新藥HDAC抑制劑MPT0E028」分別於2014年3月和12月，獲得美國食品藥品監督管理局（Food and Drug Administration, FDA）和我國食品藥物管理署（TFDA）核准進行第一期人體臨床試驗，於臺灣大學進行第一期試驗，已收治兩名病患。申請23國專利，已有多國獲證，含臺灣、美國等。【上圖：萬芳醫院（左圖）及雙和醫院（右圖）於2015年接受AAHRPP評鑑情形】
為聚焦重點研究領域，之前規劃了「癌症研究中心、神經損傷及再生研究中心、轉譯醫學研究中心、生醫材研發暨產品試製研究中心」等校級研究中心，今年再增設「細胞治療與再生醫學研究中心及考科藍臺灣中心」，計有6大研究中心；同時設置符合衛福部及國際「人體細胞組織優良操作規範」（Good Tissue Practice, GTP）的「GTP核心實驗室」，提供研究人員製備GTP級細胞製程所需設備及環境，加速細胞治療的臨床試驗推展。【左圖：建置中的GTP核心實驗室，右圖為樣品儲存桶】
有鑒於國內近年頻頻發生食安風暴，2014年5月特別與全聯實業簽約，合作設立「食品安全檢驗研究中心」，由北醫大醫學科技學院醫學檢暨生物技術學系及公共衛生暨營養學院保健營養學系等單位，以育成輔導模式進行雙方合作，協助全聯進行食品檢驗相關技術建立與提升、檢驗人才培育、提供食品安全之管理、評估、風險分析、風險溝通及危機處理與諮詢。
從充實核心實驗設施、提昇教研產學能量、加強國際合作、整合學術資源與延攬頂尖人才，北醫大正一步一腳印地持續前行，前往亞洲頂尖大學，再邁向國際一流醫學大學，歡迎所有北醫人與各界菁英加入，攜手締造北醫大的新史頁。【右圖：臺醫大於2014年接受衛生福利部食品藥物管理署委託執行「食品安全守護聯盟」計畫】
