臺南校友會歷史悠久，早在1972年即由許重勝醫師、翁安昌醫師、蘇文昌醫師、吳重德醫師等校友接連擔任會長，自發性的凝集臺南校友。這四、五十年來透過校友會的經驗傳承，凝聚許多回鄉校友，為使校友會功能更健全，並促進在地生技產業的鏈結，自2021年9月，由王玉杯藥師等32位發起人，正式向臺南市政府社會局申請立案「臺南市臺北醫學大學校友會」，中間經過兩次籌備會，終於2022年2月20日中午，在南光化學製藥公司舉辦成立大會暨第1屆第1次會員大會。
會員大會出席貴賓除了臺南校友會歷屆會長外，還有母校張文昌董事長、林建煌校長、醫學院胡朝榮副院長、藥學院劉景平院長、公共事務處蘇維文處長、校友服務組陳怡伶組長及王敬蓉組員；校友總會石公燦常務理事、醫師協會鄭永豐理事長、藥學系系友會王南淵理事長、楊家瑋常務理事、陳澤鈞秘書長、廖偉呈藥師、羅秀玲秘書。【圖：張文昌董事長（左圖）、林建煌校長（右圖）致辭】
張董事長致辭時，提及自己身為臺南人，欣喜樂見校友會日漸茁壯，也期望北醫人在臺南能夠繼續團結一心，發揮誠樸校訓，為社會貢獻一己心力。林校長則說明北醫創校62年，已培育超過4萬7千名優秀的人才，期待臺南校友會能扮演凝聚北醫人情感的交流平臺，並促進產業間的合作，讓北醫大的精神永續發展。
正式立案後第1屆由王玉杯校友擔任理事長，她是北醫藥學系第7屆校友，現任南光化學製藥股份有限公司總經理，也是105學年度企業經營類傑出校友。王理事長感謝各位校友的支持，也感謝北醫大師長的用心指導，讓自己學有所成，在藥學領域上得以發揮專長，也期盼在未來任期內可以結合校友會的力量和資源，帶領更多校友參與公共事務，提升大眾醫療知識。（文/臺南市臺北醫學大學校友會）【下圖：王玉杯會長（左4）與劉景平院長（右3）與藥學系友會團隊：楊家瑋常務理事（左1）、陳澤鈞秘書長（左2）、王南淵會長（左3）、廖偉呈藥師（右2）、羅秀玲秘書（右1）合影】
